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浅谈牡蛎长牡蛎基因区SNP标记规模开发及其在遗传育种中的运用论文格式模板下载(2)
0-133参考文献133-153在学期间发表和即将发表的文章153课题项目支持153              上一页 1 2 
70-71

3.6.3 样品基因组 DNA 提取结果71

3.6.4 引物筛选71-72

3.6.5 HRM 分型72-73

3.6.6 通量效率验证73-75

3.6.7 测序验证75-77

3.6.8 内标校正77-78

3.6.9 SNP 标记开发从及分型效率统计78-79

3.6.10 SNP 标记的定位79

3.7 讨论79-83

3.7.1 PCR 产物单一性79-80

3.7.2 额外 SNP 影响80

3.7.3 内标校正80

3.7.4 高通量分析对策80-81

3.7.5 HRM 办法改善81-82

3.7.6 长牡蛎 SNP 标记的定位及作用82-83

第三章 长牡蛎热激蛋白 HSP70 基因 SNP 标记开发及热刺激耐受相关分析83-96

1 引言83

2 实验材料83

3 实验办法83-85

3.1 高温敏感性差别群体的分离83-84

3.2 DNA 提取84

3.3 长牡蛎 HSP70 基因 SNP 标记的开发84

3.4 SNP 标记的群体检测84-85

4 结果与分析85-96

4.1 长牡蛎 HSP70 基因的获得85-86

4.2 长牡蛎 HSP70 基因 SNP 标记的开发86-88

4.3 热刺激敏感群组的划分88-89

4.4 DNA 提取89

4.5 SNP 标记群体检测结果与分析89-94

4.6 讨论94-96

第四章 长牡蛎高密度遗传连锁图谱构建96-116

1 实验及技术背景简介96-97

2 实验材料97

3 实验办法97-104

3.1 样本 DNA 提取与检测97

3.2 亲子鉴定引物设计97-100

3.3 亲子鉴定引物筛选100

3.4 测序仪分析 SSR 引物扩增片段100-101

3.5 简化基因组文库构建及测序101-103

3.6 测序数据处理103-104

3.7 遗传图谱与基因组 Scaffold 的对应104

4 实验结果与分析104-113

4.1 DNA 提取结果104

4.2 引物筛选结果检测104-105

4.3 ABI3130 测序仪片段分析105-106

4.4 测序数据统计106-107

4.5 标记统计107-108

4.6 标记编码基因型108-109

4.7 标记类型分布统计109

4.8 标记过滤109-110

4.9 两点分析与图谱构建110-112

4.10 图谱的参数统计112

4.11 图谱标记的深度分布112-113

4.12 图谱与基因组 Scaffold 的对应联系113

5 讨论113-116

第五章 基于 SNP 的巨蛎属近缘物种种质鉴定办法116-130

1 引言116-117

2 材料117

3 试验办法117-119

3.1 基因组 DNA 提取117

3.2 物种鉴定依据序列的获得117-118

3.3 巨蛎属牡蛎 COI 基因序列的比对分析118

3.4 引物设计118

3.5 引物筛选118

3.6 PCR 扩增118-119

3.7 HRM 分析样品制备119

3.8 HRM 分析119

4 实验结果与分析119-128

4.1 基因组 DNA 提取结果119

4.2 COI 基因序列测序获得与比对119-124

4.3 引物设计124

4.4 PCR 扩增结果124-125

4.5 高分辨率熔解曲线鉴定结果与分析125-127

4.6 未知物种鉴定127-128

5 讨论128-130

5.1 引物设计原则128

5.2 鉴定通量128-129

5.3 本鉴定办法的优点129-130

第六章 总结与展望130-133

参考文献133-153

在学期间发表和即将发表的文章153

课题项目支持153

 HSP70 基因的获得85-864.2 长牡蛎 HSP70 基因 SNP 标记的开发86-884.3 热刺激敏感群组的划分88-894.4 DNA 提取894.5 SNP 标记群体检测结果与分析89-944.6 讨论94-96第四章 长牡蛎高密度遗传连锁图谱构建96-1161 实验及技术背景简介96-972 实验材料973 实验办法97-1043.1 样本 DNA 提取与检测973.2 亲子鉴定引物设计97-1003

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